Das Departement Altertumswissenschaften vereint Lehre und Forschung der altertumswissenschaftlichen Fächer unter einem organisatorischen Dach. Es unterteilt sich in die FachbereicheÄgyptologie, Alte Geschichte, Gräzistik, Historisch-vergleichende Sprachwissenschaft, Klassische Archäologie, Latinistik,  Ur- und Frühgeschichtliche und Provinzialrömische Archäologie sowie in die Vindonissa-Professur für Provinzialrömische Archäologie.

Das Departement Gesellschaftswissenschaften umfasst die FachbereicheEthnologie, Gender Studies, Kulturwissenschaft und Europäische Ethnologie, Nachhaltigkeitsforschung, Nahoststudien, Politikwissenschaft, Soziologie und Urban Studies.

Das Departement Sprach- und Literaturwissenschaften ist das grösste Departement der Philosophisch-Historischen Fakultät. Es fasst die Lehrenden, Forschenden und Lernenden sowie das technisch-administrative Personal folgender Fachbereiche zu einer Planungs-, Budget- und Verwaltungseinheit zusammen: Deutsche Sprach- und Literaturwissenschaft, Englische Sprach- und Literaturwissenschaft, Französische Sprach- und Literaturwissenschaft, Iberoromanistik, Italianistik, Nordistik und Slavistik.